Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5C9

Nolc1, Nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nolc1E9Q5C9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nolc1E9Q5C9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nolc1E9Q5C9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nolc1E9Q5C9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nolc1E9Q5C9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nolc1E9Q5C9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nolc1E9Q5C9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nolc1E9Q5C9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nolc1E9Q5C9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nolc1E9Q5C9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nolc1E9Q5C9 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nolc1E9Q5C9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nolc1E9Q5C9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nolc1E9Q5C9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nolc1E9Q5C9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nolc1E9Q5C9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Nolc1E9Q5C9 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nolc1E9Q5C9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nolc1E9Q5C9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nolc1E9Q5C9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nolc1E9Q5C9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nolc1E9Q5C9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nolc1E9Q5C9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nolc1E9Q5C9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nolc1E9Q5C9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nolc1E9Q5C9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nolc1E9Q5C9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nolc1E9Q5C9 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nolc1E9Q5C9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nolc1E9Q5C9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Nolc1E9Q5C9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Nolc1E9Q5C9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nolc1E9Q5C9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nolc1E9Q5C9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nolc1E9Q5C9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nolc1E9Q5C9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nolc1E9Q5C9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nolc1E9Q5C9 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nolc1E9Q5C9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nolc1E9Q5C9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nolc1E9Q5C9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nolc1E9Q5C9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Nolc1E9Q5C9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Nolc1E9Q5C9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nolc1E9Q5C9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nolc1E9Q5C9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nolc1E9Q5C9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nolc1E9Q5C9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nolc1E9Q5C9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nolc1E9Q5C9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nolc1E9Q5C9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nolc1E9Q5C9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nolc1E9Q5C9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nolc1E9Q5C9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nolc1E9Q5C9 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Nolc1E9Q5C9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nolc1E9Q5C9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nolc1E9Q5C9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nolc1E9Q5C9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nolc1E9Q5C9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nolc1E9Q5C9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nolc1E9Q5C9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nolc1E9Q5C9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nolc1E9Q5C9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nolc1E9Q5C9 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nolc1E9Q5C9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nolc1E9Q5C9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nolc1E9Q5C9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nolc1E9Q5C9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nolc1E9Q5C9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nolc1E9Q5C9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nolc1E9Q5C9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nolc1E9Q5C9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nolc1E9Q5C9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nolc1E9Q5C9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nolc1E9Q5C9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nolc1E9Q5C9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nolc1E9Q5C9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nolc1E9Q5C9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nolc1E9Q5C9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nolc1E9Q5C9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nolc1E9Q5C9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nolc1E9Q5C9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nolc1E9Q5C9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nolc1E9Q5C9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nolc1E9Q5C9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nolc1E9Q5C9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nolc1E9Q5C9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nolc1E9Q5C9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nolc1E9Q5C9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nolc1E9Q5C9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nolc1E9Q5C9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nolc1E9Q5C9 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nolc1E9Q5C9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nolc1E9Q5C9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nolc1E9Q5C9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nolc1E9Q5C9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nolc1E9Q5C9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nolc1E9Q5C9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nolc1E9Q5C9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms