Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4S1

Pde8b, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, mousemouse

Predictions only

Length 865 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde8bE9Q4S1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pde8bE9Q4S1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pde8bE9Q4S1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Pde8bE9Q4S1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pde8bE9Q4S1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pde8bE9Q4S1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pde8bE9Q4S1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pde8bE9Q4S1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pde8bE9Q4S1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pde8bE9Q4S1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pde8bE9Q4S1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pde8bE9Q4S1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pde8bE9Q4S1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pde8bE9Q4S1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pde8bE9Q4S1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pde8bE9Q4S1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pde8bE9Q4S1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pde8bE9Q4S1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pde8bE9Q4S1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pde8bE9Q4S1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pde8bE9Q4S1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Pde8bE9Q4S1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pde8bE9Q4S1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pde8bE9Q4S1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pde8bE9Q4S1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pde8bE9Q4S1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pde8bE9Q4S1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pde8bE9Q4S1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pde8bE9Q4S1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pde8bE9Q4S1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pde8bE9Q4S1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pde8bE9Q4S1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pde8bE9Q4S1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pde8bE9Q4S1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pde8bE9Q4S1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Pde8bE9Q4S1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pde8bE9Q4S1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pde8bE9Q4S1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pde8bE9Q4S1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pde8bE9Q4S1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pde8bE9Q4S1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pde8bE9Q4S1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pde8bE9Q4S1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pde8bE9Q4S1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pde8bE9Q4S1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Pde8bE9Q4S1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pde8bE9Q4S1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pde8bE9Q4S1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pde8bE9Q4S1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Pde8bE9Q4S1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pde8bE9Q4S1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pde8bE9Q4S1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Pde8bE9Q4S1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pde8bE9Q4S1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pde8bE9Q4S1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pde8bE9Q4S1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pde8bE9Q4S1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pde8bE9Q4S1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pde8bE9Q4S1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pde8bE9Q4S1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pde8bE9Q4S1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pde8bE9Q4S1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pde8bE9Q4S1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pde8bE9Q4S1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pde8bE9Q4S1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pde8bE9Q4S1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pde8bE9Q4S1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pde8bE9Q4S1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pde8bE9Q4S1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pde8bE9Q4S1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pde8bE9Q4S1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Pde8bE9Q4S1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Pde8bE9Q4S1 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pde8bE9Q4S1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Pde8bE9Q4S1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pde8bE9Q4S1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pde8bE9Q4S1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pde8bE9Q4S1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Pde8bE9Q4S1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pde8bE9Q4S1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pde8bE9Q4S1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pde8bE9Q4S1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pde8bE9Q4S1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pde8bE9Q4S1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pde8bE9Q4S1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pde8bE9Q4S1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Pde8bE9Q4S1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Pde8bE9Q4S1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pde8bE9Q4S1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pde8bE9Q4S1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pde8bE9Q4S1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pde8bE9Q4S1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pde8bE9Q4S1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pde8bE9Q4S1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pde8bE9Q4S1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pde8bE9Q4S1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pde8bE9Q4S1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pde8bE9Q4S1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pde8bE9Q4S1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pde8bE9Q4S1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms