Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930579F01RikE9Q3L6 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms