Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vmn1r238E9Q373 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r238E9Q373 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r238E9Q373 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r238E9Q373 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r238E9Q373 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r238E9Q373 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r238E9Q373 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r238E9Q373 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r238E9Q373 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r238E9Q373 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r238E9Q373 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r238E9Q373 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r238E9Q373 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r238E9Q373 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r238E9Q373 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r238E9Q373 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r238E9Q373 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r238E9Q373 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r238E9Q373 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r238E9Q373 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r238E9Q373 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r238E9Q373 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r238E9Q373 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r238E9Q373 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r238E9Q373 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r238E9Q373 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r238E9Q373 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r238E9Q373 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r238E9Q373 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r238E9Q373 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r238E9Q373 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r238E9Q373 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r238E9Q373 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r238E9Q373 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r238E9Q373 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r238E9Q373 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r238E9Q373 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r238E9Q373 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r238E9Q373 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r238E9Q373 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r238E9Q373 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r238E9Q373 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r238E9Q373 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r238E9Q373 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r238E9Q373 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r238E9Q373 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r238E9Q373 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r238E9Q373 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r238E9Q373 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r238E9Q373 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r238E9Q373 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r238E9Q373 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r238E9Q373 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r238E9Q373 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms