Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E4

Hectd4, HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, mousemouse

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Length 4,418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd4E9Q2E4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Hectd4E9Q2E4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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