Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc171E9Q1U1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc171E9Q1U1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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