Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Myo5cE9Q1F5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Myo5cE9Q1F5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Myo5cE9Q1F5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Myo5cE9Q1F5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Myo5cE9Q1F5 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Myo5cE9Q1F5 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Myo5cE9Q1F5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Myo5cE9Q1F5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Myo5cE9Q1F5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Myo5cE9Q1F5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Myo5cE9Q1F5 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Myo5cE9Q1F5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Myo5cE9Q1F5 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Myo5cE9Q1F5 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Myo5cE9Q1F5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Myo5cE9Q1F5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Myo5cE9Q1F5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Myo5cE9Q1F5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Myo5cE9Q1F5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Myo5cE9Q1F5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Myo5cE9Q1F5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Myo5cE9Q1F5 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Myo5cE9Q1F5 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Myo5cE9Q1F5 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Myo5cE9Q1F5 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Myo5cE9Q1F5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Myo5cE9Q1F5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Myo5cE9Q1F5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Myo5cE9Q1F5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Myo5cE9Q1F5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Myo5cE9Q1F5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Myo5cE9Q1F5 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Myo5cE9Q1F5 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Myo5cE9Q1F5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Myo5cE9Q1F5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Myo5cE9Q1F5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Myo5cE9Q1F5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Myo5cE9Q1F5 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Myo5cE9Q1F5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Myo5cE9Q1F5 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Myo5cE9Q1F5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Myo5cE9Q1F5 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Myo5cE9Q1F5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Myo5cE9Q1F5 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Myo5cE9Q1F5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Myo5cE9Q1F5 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Myo5cE9Q1F5 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Myo5cE9Q1F5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Myo5cE9Q1F5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Myo5cE9Q1F5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Myo5cE9Q1F5 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Myo5cE9Q1F5 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Myo5cE9Q1F5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Myo5cE9Q1F5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Myo5cE9Q1F5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Myo5cE9Q1F5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Myo5cE9Q1F5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Myo5cE9Q1F5 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Myo5cE9Q1F5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Myo5cE9Q1F5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Myo5cE9Q1F5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Myo5cE9Q1F5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Myo5cE9Q1F5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Myo5cE9Q1F5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Myo5cE9Q1F5 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Myo5cE9Q1F5 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Myo5cE9Q1F5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Myo5cE9Q1F5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Myo5cE9Q1F5 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Myo5cE9Q1F5 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Myo5cE9Q1F5 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Myo5cE9Q1F5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Myo5cE9Q1F5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Myo5cE9Q1F5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Myo5cE9Q1F5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Myo5cE9Q1F5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Myo5cE9Q1F5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Myo5cE9Q1F5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Myo5cE9Q1F5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Myo5cE9Q1F5 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Myo5cE9Q1F5 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Myo5cE9Q1F5 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Myo5cE9Q1F5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Myo5cE9Q1F5 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Myo5cE9Q1F5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Myo5cE9Q1F5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Myo5cE9Q1F5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Myo5cE9Q1F5 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Myo5cE9Q1F5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Myo5cE9Q1F5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Myo5cE9Q1F5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Myo5cE9Q1F5 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Myo5cE9Q1F5 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Myo5cE9Q1F5 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Myo5cE9Q1F5 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Myo5cE9Q1F5 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Myo5cE9Q1F5 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Myo5cE9Q1F5 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Myo5cE9Q1F5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
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