Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm3002E9PW72 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3002E9PW72 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms