Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms