Protein–RNA interactions for Protein: E9PV48

Ifit3b, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3B, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3bE9PV48 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifit3bE9PV48 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms