Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6R0

Gm5478, Predicted pseudogene 5478, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5478D3Z6R0 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5478D3Z6R0 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5478D3Z6R0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5478D3Z6R0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5478D3Z6R0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5478D3Z6R0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5478D3Z6R0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5478D3Z6R0 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5478D3Z6R0 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5478D3Z6R0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5478D3Z6R0 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5478D3Z6R0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5478D3Z6R0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5478D3Z6R0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5478D3Z6R0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5478D3Z6R0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5478D3Z6R0 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5478D3Z6R0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5478D3Z6R0 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5478D3Z6R0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5478D3Z6R0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5478D3Z6R0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5478D3Z6R0 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5478D3Z6R0 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5478D3Z6R0 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5478D3Z6R0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5478D3Z6R0 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5478D3Z6R0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5478D3Z6R0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5478D3Z6R0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5478D3Z6R0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5478D3Z6R0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5478D3Z6R0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5478D3Z6R0 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5478D3Z6R0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5478D3Z6R0 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5478D3Z6R0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5478D3Z6R0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5478D3Z6R0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5478D3Z6R0 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5478D3Z6R0 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5478D3Z6R0 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5478D3Z6R0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5478D3Z6R0 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5478D3Z6R0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5478D3Z6R0 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5478D3Z6R0 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5478D3Z6R0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5478D3Z6R0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5478D3Z6R0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5478D3Z6R0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5478D3Z6R0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5478D3Z6R0 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5478D3Z6R0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5478D3Z6R0 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5478D3Z6R0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5478D3Z6R0 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5478D3Z6R0 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5478D3Z6R0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5478D3Z6R0 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5478D3Z6R0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5478D3Z6R0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5478D3Z6R0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5478D3Z6R0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5478D3Z6R0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5478D3Z6R0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5478D3Z6R0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5478D3Z6R0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5478D3Z6R0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5478D3Z6R0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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