Protein–RNA interactions for Protein: D3Z622

4930455H04Rik, MCG1045678, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930455H04RikD3Z622 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
4930455H04RikD3Z622 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930455H04RikD3Z622 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms