Protein–RNA interactions for Protein: D3YYB5

Gm42791, Predicted gene 42791 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm42791D3YYB5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm42791D3YYB5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm42791D3YYB5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm42791D3YYB5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm42791D3YYB5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm42791D3YYB5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm42791D3YYB5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm42791D3YYB5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm42791D3YYB5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm42791D3YYB5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm42791D3YYB5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm42791D3YYB5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms