Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc13D3YV10 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc13D3YV10 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms