Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Ube2d4D3YUH6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ube2d4D3YUH6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms