Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzd8B9EJ80 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms