Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf11cB4XVP9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms