Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pnldc1B2RXZ1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms