Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ythdc2B2RR83 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ythdc2B2RR83 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ythdc2B2RR83 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ythdc2B2RR83 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ythdc2B2RR83 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ythdc2B2RR83 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ythdc2B2RR83 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ythdc2B2RR83 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ythdc2B2RR83 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ythdc2B2RR83 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ythdc2B2RR83 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ythdc2B2RR83 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ythdc2B2RR83 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ythdc2B2RR83 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ythdc2B2RR83 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ythdc2B2RR83 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ythdc2B2RR83 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ythdc2B2RR83 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ythdc2B2RR83 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ythdc2B2RR83 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ythdc2B2RR83 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ythdc2B2RR83 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ythdc2B2RR83 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ythdc2B2RR83 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ythdc2B2RR83 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ythdc2B2RR83 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ythdc2B2RR83 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ythdc2B2RR83 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ythdc2B2RR83 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ythdc2B2RR83 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Ythdc2B2RR83 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ythdc2B2RR83 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Ythdc2B2RR83 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ythdc2B2RR83 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ythdc2B2RR83 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ythdc2B2RR83 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ythdc2B2RR83 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ythdc2B2RR83 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ythdc2B2RR83 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ythdc2B2RR83 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ythdc2B2RR83 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ythdc2B2RR83 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ythdc2B2RR83 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ythdc2B2RR83 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ythdc2B2RR83 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ythdc2B2RR83 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ythdc2B2RR83 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ythdc2B2RR83 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms