Protein–RNA interactions for Protein: B1AVB3

Scml2, Scm polycomb group protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scml2B1AVB3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scml2B1AVB3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms