Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD8

Slfn8, Schlafen 8, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn8B1ARD8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slfn8B1ARD8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms