Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms