Protein–RNA interactions for Protein: A2AT37

Upf2, UPF2 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf2A2AT37 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Upf2A2AT37 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Upf2A2AT37 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms