Protein–RNA interactions for Protein: A2ANE1

Rhox3f, Reproductive homeobox 3F, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3fA2ANE1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhox3fA2ANE1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhox3fA2ANE1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhox3fA2ANE1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhox3fA2ANE1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhox3fA2ANE1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhox3fA2ANE1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhox3fA2ANE1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhox3fA2ANE1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhox3fA2ANE1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhox3fA2ANE1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhox3fA2ANE1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhox3fA2ANE1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhox3fA2ANE1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhox3fA2ANE1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhox3fA2ANE1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhox3fA2ANE1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhox3fA2ANE1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhox3fA2ANE1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhox3fA2ANE1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhox3fA2ANE1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhox3fA2ANE1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhox3fA2ANE1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhox3fA2ANE1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhox3fA2ANE1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhox3fA2ANE1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhox3fA2ANE1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhox3fA2ANE1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhox3fA2ANE1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhox3fA2ANE1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhox3fA2ANE1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhox3fA2ANE1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhox3fA2ANE1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhox3fA2ANE1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhox3fA2ANE1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhox3fA2ANE1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhox3fA2ANE1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhox3fA2ANE1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhox3fA2ANE1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhox3fA2ANE1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhox3fA2ANE1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhox3fA2ANE1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhox3fA2ANE1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhox3fA2ANE1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhox3fA2ANE1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhox3fA2ANE1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhox3fA2ANE1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhox3fA2ANE1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhox3fA2ANE1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhox3fA2ANE1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhox3fA2ANE1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhox3fA2ANE1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhox3fA2ANE1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhox3fA2ANE1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhox3fA2ANE1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhox3fA2ANE1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhox3fA2ANE1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhox3fA2ANE1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhox3fA2ANE1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhox3fA2ANE1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhox3fA2ANE1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhox3fA2ANE1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhox3fA2ANE1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhox3fA2ANE1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhox3fA2ANE1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhox3fA2ANE1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhox3fA2ANE1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhox3fA2ANE1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhox3fA2ANE1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhox3fA2ANE1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhox3fA2ANE1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhox3fA2ANE1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhox3fA2ANE1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhox3fA2ANE1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms