Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ambra1A2AH22 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ambra1A2AH22 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms