Protein–RNA interactions for Protein: A2AGA4

Rhbdl2, Rhomboid-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl2A2AGA4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhbdl2A2AGA4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdl2A2AGA4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms