Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pramef6A2A8M8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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