Protein–RNA interactions for Protein: A1L3C1

Fam71e1, Protein FAM71E1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71e1A1L3C1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fam71e1A1L3C1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms