Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1K3

B230359F08Rik, RIKEN cDNA B230359F08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms