Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YWQ1

Trbv23, T cell receptor beta, variable V23 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trbv23A0A0A6YWQ1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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