Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 SEC61G-201ENST00000352861 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 AC092634.1-201ENST00000366505 199 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 RN7SKP221-201ENST00000410420 301 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 RNA5SP155-201ENST00000411154 129 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 MEAF6P1-201ENST00000416092 327 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 AC006509.1-201ENST00000420788 634 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 AC009567.2-201ENST00000502989 349 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 AC093664.1-201ENST00000511779 289 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 AC022509.1-202ENST00000537525 494 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 AC025419.1-203ENST00000540652 726 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 AP000851.1-202ENST00000542119 743 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 AC009729.1-201ENST00000548873 1133 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 AC105243.1-201ENST00000563172 1165 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 LINC01855-201ENST00000585520 396 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 AC006262.3-201ENST00000597337 258 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 AC027334.1-201ENST00000603257 310 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 MRPL47-201ENST00000259038 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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SYCP1Q15431 AC092941.2-201ENST00000444379 1008 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 AL133319.1-201ENST00000447848 777 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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SYCP1Q15431 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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SYCP1Q15431 AC245519.1-201ENST00000522799 512 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 PATE4-203ENST00000534411 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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SYCP1Q15431 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 AC119674.1-217ENST00000641942 1086 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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SYCP1Q15431 ZFP62-201ENST00000502412 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
SYCP1Q15431 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 SULT1C3-201ENST00000329106 915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 PAGE2-201ENST00000374965 456 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
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