Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 AC211486.4-201ENST00000621495 113 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 AC006328.2-201ENST00000623198 397 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 AC005514.1-201ENST00000623521 208 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 AC012005.2-201ENST00000624333 397 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 ARFGAP2-230ENST00000629231 213 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 MEF2C-254ENST00000637732 3347 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 RRS1-AS1-201ENST00000499642 4366 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 DEUP1-209ENST00000531792 1656 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 NREP-206ENST00000447165 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 AKR1C2-201ENST00000380753 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 OLFM4-201ENST00000219022 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 GABRR1-206ENST00000611484 3259 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 CCDC102B-210ENST00000584156 1554 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 PJA2-201ENST00000361189 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 TIA1-201ENST00000282574 3823 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 LRRC37B-201ENST00000327564 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 GABRB2-201ENST00000274547 7409 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 TCP11X2-202ENST00000453326 1747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 TCP11X1-201ENST00000597070 1747 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 BX322650.1-201ENST00000332359 2143 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 AL353743.3-201ENST00000442109 1468 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 SP110-201ENST00000258381 2426 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 ERMARD-202ENST00000366772 2003 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 MYO5A-209ENST00000553916 5989 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 PAQR5-201ENST00000340965 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 FBXW7-201ENST00000263981 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 AC007406.5-201ENST00000570140 3170 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 PAICS-208ENST00000514888 3340 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
SGCZQ96LD1 NRXN3-207ENST00000554719 4156 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SGCZQ96LD1 SH2D1B-201ENST00000367929 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SGCZQ96LD1 PCLO-203ENST00000423517 17147 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SGCZQ96LD1 ADH1B-201ENST00000305046 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SGCZQ96LD1 CHORDC1-201ENST00000320585 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SGCZQ96LD1 IFNK-201ENST00000276943 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SGCZQ96LD1 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SGCZQ96LD1 TRIM55-203ENST00000350034 1177 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SGCZQ96LD1 OR5B21-201ENST00000360374 931 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SGCZQ96LD1 RNA5SP321-201ENST00000362722 111 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SGCZQ96LD1 RNU1-55P-201ENST00000365510 158 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SGCZQ96LD1 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SGCZQ96LD1 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SGCZQ96LD1 FDPSP5-201ENST00000399474 1057 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SGCZQ96LD1 AL359922.1-201ENST00000404796 935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SGCZQ96LD1 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SGCZQ96LD1 AL033519.1-201ENST00000407266 307 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SGCZQ96LD1 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SGCZQ96LD1 Z82198.3-201ENST00000421145 199 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SGCZQ96LD1 AL512363.1-201ENST00000425089 586 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SGCZQ96LD1 AL596268.1-201ENST00000427910 1048 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SGCZQ96LD1 GAPDHP19-201ENST00000431768 1005 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SGCZQ96LD1 AC006055.1-201ENST00000432423 411 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SGCZQ96LD1 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SGCZQ96LD1 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SGCZQ96LD1 LINC01918-202ENST00000438148 415 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SGCZQ96LD1 GABRG3-AS1-201ENST00000439938 970 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SGCZQ96LD1 NPM1P23-201ENST00000440193 849 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SGCZQ96LD1 IGKV1OR10-1-201ENST00000442306 329 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SGCZQ96LD1 CRYGGP-201ENST00000443337 145 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SGCZQ96LD1 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SGCZQ96LD1 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SGCZQ96LD1 LIX1L-AS1-206ENST00000447686 846 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SGCZQ96LD1 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SGCZQ96LD1 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SGCZQ96LD1 IGKV1OR22-5-201ENST00000458718 354 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SGCZQ96LD1 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SGCZQ96LD1 LINC02059-201ENST00000503843 452 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SGCZQ96LD1 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SGCZQ96LD1 AC109588.1-201ENST00000507759 726 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SGCZQ96LD1 AC011352.2-201ENST00000514574 1016 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SGCZQ96LD1 AC022915.3-201ENST00000518620 594 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SGCZQ96LD1 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SGCZQ96LD1 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SGCZQ96LD1 PATE4-203ENST00000534411 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SGCZQ96LD1 AC140063.1-201ENST00000541343 259 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SGCZQ96LD1 AC007068.2-201ENST00000543168 395 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SGCZQ96LD1 OR11H12-201ENST00000550708 1085 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SGCZQ96LD1 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SGCZQ96LD1 FXNP1-201ENST00000555153 337 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SGCZQ96LD1 AC136285.2-201ENST00000562873 378 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SGCZQ96LD1 AC007496.2-201ENST00000564801 547 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SGCZQ96LD1 MDFIC2-201ENST00000567252 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SGCZQ96LD1 ANP32BP1-202ENST00000568553 737 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SGCZQ96LD1 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SGCZQ96LD1 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SGCZQ96LD1 AC040963.1-201ENST00000591900 564 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SGCZQ96LD1 AC020914.2-201ENST00000598220 430 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SGCZQ96LD1 AL049840.5-201ENST00000602827 552 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SGCZQ96LD1 AC005828.7-201ENST00000607331 556 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SGCZQ96LD1 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SGCZQ96LD1 HTR1DP1-201ENST00000616500 888 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SGCZQ96LD1 AL445528.2-201ENST00000620582 470 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SGCZQ96LD1 AC095038.2-201ENST00000621464 1070 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SGCZQ96LD1 AL450226.2-201ENST00000622913 439 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SGCZQ96LD1 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SGCZQ96LD1 AL078581.3-201ENST00000627304 744 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SGCZQ96LD1 SNORA16A-202ENST00000628458 135 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
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