Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm24147-201ENSMUST00000082763 144 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Gm25855-201ENSMUST00000082787 72 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Gm24536-201ENSMUST00000083144 107 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Scn1a-201ENSMUST00000077489 8116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Ankar-202ENSMUST00000211837 4543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Gm37899-201ENSMUST00000193116 8717 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Trim23-202ENSMUST00000069174 4258 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Vmn1r193-204ENSMUST00000228303 6653 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Kbtbd8-202ENSMUST00000119582 4518 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Gm6853-202ENSMUST00000211360 4375 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Kmt2c-201ENSMUST00000045291 14967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Homez-201ENSMUST00000081162 5609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Arhgef6-201ENSMUST00000033468 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 C87414-206ENSMUST00000162964 2852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Slco6c1-201ENSMUST00000027569 2747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Cntn3-201ENSMUST00000032159 5183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Gm13862-201ENSMUST00000121220 197 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 4930527E20Rik-201ENSMUST00000135700 351 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Gm23666-201ENSMUST00000158053 116 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Gm26290-201ENSMUST00000158891 145 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Mir3103-201ENSMUST00000175474 67 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Gm13249-201ENSMUST00000177803 345 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Gm13144-201ENSMUST00000179385 345 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 AC125405.1-201ENSMUST00000226406 589 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Vmn1r13-204ENSMUST00000227421 5235 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Yae1d1-201ENSMUST00000099735 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Ptprj-202ENSMUST00000111495 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Olfr810-204ENSMUST00000217283 4527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Gm32444-201ENSMUST00000195147 3511 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Olfr716-207ENSMUST00000216871 4062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Mroh9-201ENSMUST00000096608 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Olfr1341-203ENSMUST00000215117 4700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Gm29666-201ENSMUST00000189185 8038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Olfr720-204ENSMUST00000217642 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Copg2-201ENSMUST00000048774 3961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Gm25728-201ENSMUST00000104525 159 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Gm24186-201ENSMUST00000157983 127 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Gm26170-201ENSMUST00000158419 148 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Gm10087-201ENSMUST00000167650 330 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Mir6412-201ENSMUST00000184477 97 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Mir7009-201ENSMUST00000184519 64 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 AC157602.1-201ENSMUST00000197446 105 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 1700027F06Rik-201ENSMUST00000203901 243 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Gm45197-201ENSMUST00000205288 151 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 1700010L04Rik-201ENSMUST00000032872 330 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Snord118-201ENSMUST00000082965 135 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Abi3bp-202ENSMUST00000096012 4387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 AC158979.1-201ENSMUST00000223594 2252 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Gm42888-201ENSMUST00000202425 4361 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Scaper-205ENSMUST00000217647 4370 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Shoc2-202ENSMUST00000169861 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Kcnma1-208ENSMUST00000177634 4605 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Gm5141-202ENSMUST00000201047 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 AC156025.1-201ENSMUST00000223597 3551 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Vmn1r184-206ENSMUST00000228145 5888 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Samd8-202ENSMUST00000119430 6801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Gm8260-201ENSMUST00000119230 353 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Gm16328-201ENSMUST00000126985 196 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Gm23667-201ENSMUST00000157466 120 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Gm23900-201ENSMUST00000157569 108 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Mir6402-201ENSMUST00000183406 80 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Mir199a-2-201ENSMUST00000093618 110 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Asah2-201ENSMUST00000096119 4682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Clmn-201ENSMUST00000109936 11866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 AC123035.1-201ENSMUST00000213846 2671 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Ppargc1a-203ENSMUST00000132734 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Gm2123-201ENSMUST00000221476 2836 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Olfr1381-202ENSMUST00000213256 4954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Gabrg1-201ENSMUST00000031119 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Olfr1370-203ENSMUST00000215357 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 AC139218.1-201ENSMUST00000228215 4287 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Txndc9-204ENSMUST00000193832 3472 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 C230085N15Rik-201ENSMUST00000194893 4327 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Gm16561-201ENSMUST00000163001 192 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Gm25648-201ENSMUST00000177844 79 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 AC168056.1-201ENSMUST00000225270 180 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Olfr609-202ENSMUST00000216075 3429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Jrkl-201ENSMUST00000110582 3223 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Dnajc13-203ENSMUST00000186788 6747 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Gcnt2-203ENSMUST00000110191 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Gm12018-201ENSMUST00000150694 3375 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Ino80d-201ENSMUST00000097718 13675 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Ryr3-201ENSMUST00000080673 15422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Svet1-201ENSMUST00000209370 3940 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Oxr1-202ENSMUST00000090095 4156 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Ak9-201ENSMUST00000173494 6968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Gm23060-201ENSMUST00000102345 109 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Gm3848-201ENSMUST00000136693 299 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Gm25965-201ENSMUST00000157170 93 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Gm26133-201ENSMUST00000157363 100 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Gm25241-201ENSMUST00000174909 84 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Gm26217-201ENSMUST00000175212 84 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Gm27718-201ENSMUST00000183721 86 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Gm45796-201ENSMUST00000212483 114 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Olfr1193-202ENSMUST00000213893 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Akap5-202ENSMUST00000154078 6685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Abcc9-204ENSMUST00000111771 7499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Dsc1-201ENSMUST00000038710 3775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Olfr1256-203ENSMUST00000213833 6081 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Hoxd11P23813 Olfr348-203ENSMUST00000214909 3634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
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