Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 ARHGAP32-201ENST00000310343 10111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 TBC1D32-201ENST00000275159 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 PSMC1P4-201ENST00000515236 1327 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 OR1I1-201ENST00000209540 1242 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 RNU1-5P-201ENST00000362684 144 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 SNORA38B-201ENST00000363524 131 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 PAGE2-201ENST00000374965 456 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 U3.52-201ENST00000384034 216 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 FAR1P1-201ENST00000427163 934 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AL390198.2-201ENST00000510553 222 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AC026785.3-201ENST00000511182 285 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AC010634.1-201ENST00000513925 540 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AC097501.1-202ENST00000514707 313 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 RAB30-209ENST00000532548 644 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC9.66□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AC024145.1-201ENST00000535324 775 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AC063926.1-201ENST00000539532 415 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 CNEP1R1-204ENST00000562576 656 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AL390718.1-201ENST00000566904 506 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 ZNF137P-202ENST00000597158 308 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 RNASE11-211ENST00000620912 883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 OR5M2P-202ENST00000641241 4242 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 GLYATL1P1-201ENST00000528297 1607 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AP000641.1-201ENST00000531988 1639 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 RPL31P11-201ENST00000426558 1558 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 METTL8-217ENST00000612742 8132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 RALYL-204ENST00000518566 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 ADGRB3-203ENST00000546190 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 CCDC150P1-201ENST00000537123 2215 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 EYA3-204ENST00000436342 5943 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 MAPKAPK5P1-201ENST00000431810 1376 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 LRRC37A15P-201ENST00000514785 1355 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 SF3B1-201ENST00000335508 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 TTTY4B-201ENST00000420149 1346 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 TTTY4-201ENST00000436568 1346 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 TTTY4C-201ENST00000456123 1346 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 MLH3-202ENST00000380968 7819 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 PPIAP24-201ENST00000328558 471 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 PAGE2B-201ENST00000374971 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 MT-RNR1-201ENST00000389680 954 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AC026310.1-201ENST00000396004 378 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AL022324.2-201ENST00000434827 780 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 UBQLN1P1-207ENST00000441056 1169 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 GAPDHP33-201ENST00000443168 1013 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 LIX1L-AS1-206ENST00000447686 846 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AKR1D1P1-201ENST00000457236 936 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 EIF2S2P4-201ENST00000461070 984 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 RAB7A-208ENST00000493186 329 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AC139713.2-204ENST00000511042 342 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AC022784.1-201ENST00000512942 699 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AC124242.1-205ENST00000517798 646 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 FBXO16-207ENST00000518734 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 OR4A13P-201ENST00000529316 942 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 LINC02422-201ENST00000535163 852 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 ASB8-207ENST00000536953 923 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 FAM174B-202ENST00000553393 495 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AP3S2-214ENST00000560940 519 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 BNIP3P32-201ENST00000600015 554 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AC245052.7-201ENST00000601161 359 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 SNX18P10-201ENST00000625014 519 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 FAM208A-210ENST00000614531 3441 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 MDM4-215ENST00000614459 9782 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 AC023245.2-201ENST00000530760 2978 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 KIF20A-201ENST00000394894 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 RGS22-215ENST00000523437 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 FAM83B-201ENST00000306858 3167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.8 ms