Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 AC165106.3-201ENSMUST00000228191 3843 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Il18r1-202ENSMUST00000108044 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Dleu2-202ENSMUST00000180917 3544 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Vmn2r82-201ENSMUST00000170596 3045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Zranb2-202ENSMUST00000106057 2737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 n-R5s26-201ENSMUST00000104601 122 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Gm12412-201ENSMUST00000121867 328 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Gm27805-201ENSMUST00000184513 79 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Gm9370-201ENSMUST00000222787 609 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Pcdh15-234ENSMUST00000191854 9104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Evi5-201ENSMUST00000112642 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Zfp712-201ENSMUST00000167565 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Vmn1r90-201ENSMUST00000185220 7144 ntAPPRIS P2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Rbm41-203ENSMUST00000113007 3691 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Smgc-201ENSMUST00000088555 2977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Csnk1g1-201ENSMUST00000034949 7208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Olfr576-201ENSMUST00000098213 3132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Themis-203ENSMUST00000105516 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Zfp799-205ENSMUST00000202988 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Hyal6-201ENSMUST00000031690 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Usp46-201ENSMUST00000068058 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Gm23993-201ENSMUST00000157478 144 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Gm25535-201ENSMUST00000175364 125 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Gm28660-201ENSMUST00000186496 253 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Gm44024-201ENSMUST00000203008 476 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Gm19908-201ENSMUST00000204684 391 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Gm22507-201ENSMUST00000082773 160 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Sfmbt2-201ENSMUST00000041105 7874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Abca6-201ENSMUST00000044003 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Olfr1447-203ENSMUST00000216989 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Ube2n-201ENSMUST00000099329 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Zfp287-206ENSMUST00000185656 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Zbed4-ps2-201ENSMUST00000187003 3448 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Chd9-205ENSMUST00000209423 9419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 AC130827.1-201ENSMUST00000220476 3850 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 AW554918-208ENSMUST00000165400 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 AW554918-202ENSMUST00000097643 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Fam196b-201ENSMUST00000093192 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Tnfaip3-202ENSMUST00000105527 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Olfr1238-202ENSMUST00000217226 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Gm33148-201ENSMUST00000210835 7227 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 AC166343.1-201ENSMUST00000213261 577 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 AC115034.1-201ENSMUST00000215393 3846 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Gm25635-201ENSMUST00000082675 131 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Noc3l-201ENSMUST00000025963 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Tlr11-202ENSMUST00000185091 3207 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Emsy-207ENSMUST00000205911 5079 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Kat6a-201ENSMUST00000044331 9113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Helz-203ENSMUST00000106746 13147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Gm37086-201ENSMUST00000193082 3452 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Ndufaf4-201ENSMUST00000029925 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Zfp280c-204ENSMUST00000114940 3863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Scn3a-202ENSMUST00000100069 8550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Dsc1-202ENSMUST00000224432 4085 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Gm16523-202ENSMUST00000203640 4750 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Fscb-201ENSMUST00000059833 3361 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Gm37400-201ENSMUST00000193148 3605 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Gm23485-201ENSMUST00000104181 155 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Mir293-201ENSMUST00000104841 80 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 n-R5s73-201ENSMUST00000122508 107 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Gm24632-201ENSMUST00000122770 323 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Galnt5-203ENSMUST00000166729 3812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Mir6418-201ENSMUST00000185075 115 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Gsdme-202ENSMUST00000101405 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Olfr307-203ENSMUST00000217494 4515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Atp13a5-201ENSMUST00000075806 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Gdpd4-201ENSMUST00000041860 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Gm45884-201ENSMUST00000209540 3416 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Olfr836-202ENSMUST00000212730 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Olfr836-203ENSMUST00000215981 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Spef2-201ENSMUST00000041840 4247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Itih4-203ENSMUST00000120269 3531 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Cul4b-203ENSMUST00000115118 3344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Olfr1226-205ENSMUST00000216445 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Rbbp6-203ENSMUST00000098062 6345 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Tlr3-201ENSMUST00000034056 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Chl1-203ENSMUST00000203830 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Gm45844-205ENSMUST00000210333 3861 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Gm12422-201ENSMUST00000121431 302 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Gm22815-201ENSMUST00000157451 62 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Gm22159-201ENSMUST00000158412 130 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Gm8790-201ENSMUST00000194108 322 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 n-R5s65-201ENSMUST00000082614 117 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Postn-204ENSMUST00000117373 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Olfr694-204ENSMUST00000216895 4853 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Vmn1r45-203ENSMUST00000227122 2861 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Olfr613-201ENSMUST00000106888 5139 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Ankfy1-206ENSMUST00000155998 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Cyld-202ENSMUST00000098519 7954 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Olfr398-203ENSMUST00000214334 5348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Olfr791-202ENSMUST00000217228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Ncoa6-201ENSMUST00000043126 6872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Zfp994-201ENSMUST00000179996 4880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Morc2b-202ENSMUST00000131954 3857 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Mir551b-201ENSMUST00000102165 98 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Gm17133-201ENSMUST00000170636 289 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 Gm25197-201ENSMUST00000175516 126 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 AC159821.1-201ENSMUST00000214934 248 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd11P23813 A430110C17Rik-201ENSMUST00000195666 4348 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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