Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Utp20-201ENSMUST00000004470 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Dopey1-218ENSMUST00000190957 9187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Mug2-201ENSMUST00000081777 4579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Zfp568-202ENSMUST00000146074 6867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Vmn1r202-202ENSMUST00000228020 5441 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Atp12a-201ENSMUST00000007340 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Olfr767-202ENSMUST00000213579 5493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Olfr1423-202ENSMUST00000214472 5570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Birc6-223ENSMUST00000183224 14562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Gm38706-201ENSMUST00000182397 2617 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Igkv12-98-201ENSMUST00000103327 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Gm12213-201ENSMUST00000119924 353 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Gm5809-201ENSMUST00000121854 529 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Gm23789-201ENSMUST00000122536 301 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Vmn2r-ps54-202ENSMUST00000150147 2952 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Gm23168-201ENSMUST00000157156 143 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Gm22569-201ENSMUST00000175545 124 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Mir7578-201ENSMUST00000183455 82 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 n-R5s89-201ENSMUST00000083532 104 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Dnah17-204ENSMUST00000132685 13612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Naip2-201ENSMUST00000067975 4709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 2810021J22Rik-201ENSMUST00000073924 3866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Spta1-201ENSMUST00000027817 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Ccdc82-201ENSMUST00000110583 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Creb5-212ENSMUST00000205120 7482 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Cdk14-201ENSMUST00000030763 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Gm9921-201ENSMUST00000173293 4399 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Thap6-201ENSMUST00000191860 3151 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Slamf6-201ENSMUST00000171330 2485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Sntg1-210ENSMUST00000191683 4510 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Gm42798-201ENSMUST00000200853 3972 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Cacnb4-203ENSMUST00000102761 8039 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Olfr853-202ENSMUST00000213834 3888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Gm43210-201ENSMUST00000196743 6152 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Gm37838-201ENSMUST00000194464 312 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 BX530055.1-201ENSMUST00000197285 122 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Gabrg2-201ENSMUST00000070725 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Rfx3-201ENSMUST00000046898 4274 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Zfp462-203ENSMUST00000098070 10465 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Sox6-210ENSMUST00000206034 8668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 St18-208ENSMUST00000140079 5892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 0610010F05Rik-202ENSMUST00000093267 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Gm37529-201ENSMUST00000195618 4321 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Slc7a2-201ENSMUST00000057784 7910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Olfr819-202ENSMUST00000216322 3930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Pcdh15-215ENSMUST00000131321 6926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Olfr129-202ENSMUST00000216476 5275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Ptprz1-206ENSMUST00000202579 6871 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Slc30a7-201ENSMUST00000067485 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Abcb11-201ENSMUST00000102709 5025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Gabpb2-202ENSMUST00000098873 8272 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Pias1-201ENSMUST00000098651 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Dnah10-201ENSMUST00000058440 14038 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Gm23766-201ENSMUST00000103894 80 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Gm25386-201ENSMUST00000157814 288 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Gm16584-201ENSMUST00000159267 189 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Gm23649-201ENSMUST00000179007 107 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Gm27952-201ENSMUST00000184748 105 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Gm44459-201ENSMUST00000203926 160 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Svbp-204ENSMUST00000210595 150 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Gm25856-201ENSMUST00000082786 75 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Mir125b-2-201ENSMUST00000083538 71 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Mir494-201ENSMUST00000093632 85 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Arl5b-201ENSMUST00000017562 6933 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Pcdh9-208ENSMUST00000195826 6521 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Lpin2-203ENSMUST00000126681 4167 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Lrtm1-201ENSMUST00000055662 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Pik3ca-202ENSMUST00000108242 6171 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Olfr1442-204ENSMUST00000208657 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Cd44-201ENSMUST00000005218 5614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Ddx3y-201ENSMUST00000091190 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Gm42770-201ENSMUST00000199657 4155 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Gm38082-201ENSMUST00000192800 6882 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 AC152979.2-201ENSMUST00000219702 3814 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Cped1-202ENSMUST00000115383 5690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Golga1-202ENSMUST00000112850 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Casp8ap2-205ENSMUST00000178925 6557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Atp2b1-201ENSMUST00000020107 7130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Olfr884-202ENSMUST00000181088 3185 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Atm-201ENSMUST00000118282 10006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 n-R5s219-201ENSMUST00000104328 132 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Gemin6-ps-201ENSMUST00000120444 501 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Snora33-201ENSMUST00000093556 129 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Spag5-201ENSMUST00000045026 3887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Vmn1r184-203ENSMUST00000227232 8472 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Otogl-201ENSMUST00000165341 8763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Zfp763-201ENSMUST00000087654 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Vmn1r42-203ENSMUST00000227279 4138 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Foxr2-201ENSMUST00000096265 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Gm42552-201ENSMUST00000196754 4497 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Tpx2-207ENSMUST00000178997 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Naip3-201ENSMUST00000118082 4208 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Map3k19-201ENSMUST00000061512 3936 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Slc28a3-201ENSMUST00000022036 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Atp10b-201ENSMUST00000077659 6825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Zfp40-206ENSMUST00000172177 2736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Ktn1-223ENSMUST00000190999 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Rlim-201ENSMUST00000070705 7429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Gm17131-201ENSMUST00000164420 3846 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd11P23813 Gm43540-201ENSMUST00000196320 3848 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.3 ms