Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vstm4T1NXB5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms