Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mbd4Q9Z2D7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mbd4Q9Z2D7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms