Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms