Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z172

Sumo3, Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3Q9Z172 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Sumo3Q9Z172 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Sumo3Q9Z172 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms