Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E6

Gbp2, Guanylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp2Q9Z0E6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gbp2Q9Z0E6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gbp2Q9Z0E6 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gbp2Q9Z0E6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gbp2Q9Z0E6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbp2Q9Z0E6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbp2Q9Z0E6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbp2Q9Z0E6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbp2Q9Z0E6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbp2Q9Z0E6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbp2Q9Z0E6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbp2Q9Z0E6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbp2Q9Z0E6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbp2Q9Z0E6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbp2Q9Z0E6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbp2Q9Z0E6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbp2Q9Z0E6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbp2Q9Z0E6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbp2Q9Z0E6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbp2Q9Z0E6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbp2Q9Z0E6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbp2Q9Z0E6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbp2Q9Z0E6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbp2Q9Z0E6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbp2Q9Z0E6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbp2Q9Z0E6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbp2Q9Z0E6 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gbp2Q9Z0E6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms