Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ0

Pmfbp1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmfbp1Q9WVQ0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pmfbp1Q9WVQ0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms