Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVB4

Slit3, Slit homolog 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit3Q9WVB4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slit3Q9WVB4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slit3Q9WVB4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slit3Q9WVB4 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slit3Q9WVB4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Slit3Q9WVB4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slit3Q9WVB4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slit3Q9WVB4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slit3Q9WVB4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slit3Q9WVB4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slit3Q9WVB4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slit3Q9WVB4 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slit3Q9WVB4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slit3Q9WVB4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Slit3Q9WVB4 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slit3Q9WVB4 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slit3Q9WVB4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slit3Q9WVB4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slit3Q9WVB4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Slit3Q9WVB4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slit3Q9WVB4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slit3Q9WVB4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slit3Q9WVB4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slit3Q9WVB4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slit3Q9WVB4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slit3Q9WVB4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slit3Q9WVB4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slit3Q9WVB4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slit3Q9WVB4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slit3Q9WVB4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slit3Q9WVB4 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slit3Q9WVB4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slit3Q9WVB4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slit3Q9WVB4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slit3Q9WVB4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slit3Q9WVB4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slit3Q9WVB4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slit3Q9WVB4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slit3Q9WVB4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slit3Q9WVB4 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Slit3Q9WVB4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slit3Q9WVB4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slit3Q9WVB4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slit3Q9WVB4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slit3Q9WVB4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slit3Q9WVB4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Slit3Q9WVB4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slit3Q9WVB4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slit3Q9WVB4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Slit3Q9WVB4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slit3Q9WVB4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slit3Q9WVB4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slit3Q9WVB4 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slit3Q9WVB4 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slit3Q9WVB4 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Slit3Q9WVB4 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slit3Q9WVB4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slit3Q9WVB4 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slit3Q9WVB4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Slit3Q9WVB4 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slit3Q9WVB4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slit3Q9WVB4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slit3Q9WVB4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slit3Q9WVB4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slit3Q9WVB4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slit3Q9WVB4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slit3Q9WVB4 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms