Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Psma1Q9R1P4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Psma1Q9R1P4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Psma1Q9R1P4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Psma1Q9R1P4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Psma1Q9R1P4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Psma1Q9R1P4 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Psma1Q9R1P4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psma1Q9R1P4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psma1Q9R1P4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psma1Q9R1P4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psma1Q9R1P4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psma1Q9R1P4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psma1Q9R1P4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psma1Q9R1P4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psma1Q9R1P4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psma1Q9R1P4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psma1Q9R1P4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psma1Q9R1P4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psma1Q9R1P4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Psma1Q9R1P4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psma1Q9R1P4 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psma1Q9R1P4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psma1Q9R1P4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psma1Q9R1P4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psma1Q9R1P4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psma1Q9R1P4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Psma1Q9R1P4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psma1Q9R1P4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psma1Q9R1P4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psma1Q9R1P4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psma1Q9R1P4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psma1Q9R1P4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psma1Q9R1P4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psma1Q9R1P4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psma1Q9R1P4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psma1Q9R1P4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psma1Q9R1P4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psma1Q9R1P4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psma1Q9R1P4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psma1Q9R1P4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psma1Q9R1P4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psma1Q9R1P4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psma1Q9R1P4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psma1Q9R1P4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psma1Q9R1P4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psma1Q9R1P4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psma1Q9R1P4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psma1Q9R1P4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psma1Q9R1P4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psma1Q9R1P4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psma1Q9R1P4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psma1Q9R1P4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psma1Q9R1P4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psma1Q9R1P4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psma1Q9R1P4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psma1Q9R1P4 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psma1Q9R1P4 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psma1Q9R1P4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psma1Q9R1P4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psma1Q9R1P4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psma1Q9R1P4 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psma1Q9R1P4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psma1Q9R1P4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psma1Q9R1P4 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psma1Q9R1P4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psma1Q9R1P4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psma1Q9R1P4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psma1Q9R1P4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Psma1Q9R1P4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psma1Q9R1P4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Psma1Q9R1P4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psma1Q9R1P4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psma1Q9R1P4 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psma1Q9R1P4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psma1Q9R1P4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psma1Q9R1P4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psma1Q9R1P4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psma1Q9R1P4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psma1Q9R1P4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psma1Q9R1P4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psma1Q9R1P4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psma1Q9R1P4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Psma1Q9R1P4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psma1Q9R1P4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Psma1Q9R1P4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psma1Q9R1P4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psma1Q9R1P4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psma1Q9R1P4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psma1Q9R1P4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psma1Q9R1P4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psma1Q9R1P4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psma1Q9R1P4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psma1Q9R1P4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Psma1Q9R1P4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psma1Q9R1P4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psma1Q9R1P4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psma1Q9R1P4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psma1Q9R1P4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psma1Q9R1P4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms