Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Psma4Q9R1P0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms