Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Wdr54Q9R0D8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Wdr54Q9R0D8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms