Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnnt3Q9QZ47 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnnt3Q9QZ47 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms