Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Six6Q9QZ28 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Six6Q9QZ28 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Six6Q9QZ28 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Six6Q9QZ28 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms