Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cbx8Q9QXV1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cbx8Q9QXV1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms