Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXJ1

Apbb1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb1Q9QXJ1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apbb1Q9QXJ1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apbb1Q9QXJ1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apbb1Q9QXJ1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms